日陰ぼっこのススメほんの数日前まで当たり前だった、どんよりした空模様や肌寒さはどこへやら、空には燦々と輝く太陽に、入道雲も現れ、まさに夏本番という景色が広がっていた。

日差しが降り注ぐ放課後の、忍術学園校庭は、次々と駆け出してくる忍たまたちで、賑わい始めた。
その様子を校舎の窓から眺めつつ、一人の少年が、同じく教室に残った三人の友人たちに声をかける。

「今日は何する？」
「「「いつものあれが良いな……」」」

三人は、声を揃えて即答した。

「そうだね。じゃあ、行こうか……」

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「今日はここが良い感じかな。」
「"日陰ぼっこ"はじめよう……。」

広い校庭の片隅には、太陽の角度と建物や植木の配置によって、日陰になる場所が点在している。

想い伊作のお父さんが薬師かお医者さんで、よく一緒に薬草つみに行っていたから知識も豊富になった。元々心優しい子で、人や動物など傷ついたものを放っておけなかった。しかし悲劇はやってくる。伊作が9つのときだった。
父が敵領地近くの山で薬草を採っていたところ、戦真っ只中の敵兵士に見つかり殺されてしまう。帰ってこない父を心配した伊作と母は同じ村の人から父の最期を聞かされる。それからというもの、母は病を患い、住んでいた村は皮肉なことに敵領地になってしまう。
「どうして……どうして父さんは……母さん……僕はどうしたらいい……？？」
そう問いかけると母は困ったように笑い
「うーん…………忍者だったら……もしかしたら……この戦も止められたかもね……」